Andrei Șaguna (nume de botez - Anastasiu) s-a născut pe 20 decembrie 1808/ 1 ianuarie 1809, la Miskolc, Ungaria. Studiile gimnaziale le-a făcut la Miskolc și Pesta, iar pe cele superioare, de Filosofie și Drept, la Universitatea din Pesta, în perioada 1826-1829, și de Teologie, la Seminarul de la Vârșeț.
După terminarea studiilor teologice, a intrat în mănăstirea sârbească Novo Hopovo, unde a fost tuns în monahism sub numele de Andrei, la 24 octombrie 1833. A fost hirotonit ierodiacon în februarie 1834 şi ieromonah pe 29 iunie 1837. În 1846, a fost numit vicar general al Episcopiei Ardealului, cu sediul la Sibiu, iar un an mai târziu a fost ales episcop. În 1864, a fost numit arhiepiscop și mitropolit al reînființatei Mitropolii a Transilvaniei, stabilindu-și reședința la Sibiu.
Andrei Șaguna a fost un militant al restaurării vechii Mitropolii a Transilvaniei, prin memoriile înaintate Curții de la Viena, Patriarhului ortodox sârb și Congresului Național Bisericesc sârb din Carlowitz. A convocat la Sibiu, în anii 1850-1864, sinoade eparhiale - formate din clerici și mireni, care au luat în discuție reînființarea Mitropoliei. În 1864, Mitropolia Transilvaniei, cu cele două eparhii sufragante - Arad și Caransebeș - a fost reînființată. După acest eveniment, Andrei Șaguna a convocat, în 1868, un sinod la Sibiu, care a aprobat statutul organic al Bisericii Ortodoxe Române din Transilvania. Principiile fundamentale ale acestui statut - autonomia față de stat și sinodalitatea (participarea laicilor alături de clerici la conducerea Bisericii) - au stat la baza statutului de organizare a Bisericii Ortodoxe Române din anul 1925 și al celui din 1948.
În zona culturală, a organizat învățământul elementar și mediu din Transilvania și l-a pus sub îndrumarea Bisericii, această situație fiind instituită în Statutul Organic al învățământului. Prin fondurile și fundațiile înființate, Andrei Șaguna a trimis la studii în străinătate tineri români care doreau să se specializeze la universități din Austria și Germania. În 1853, a întemeiat ziarul "Telegraful Român" (subintitulat "Gazeta politică, industrială, comercială și literară"). Apărut sub egida Bisericii, ziarul avea un caracter multilateral - religios, național și politic.
Pe 16/28 iunie 1873, Andrei Șaguna a decedat, la Sibiu, unde a creat o școală a teologiei ortodoxe transilvănene care-i poartă numele.